En partant du cœur de l’Afrique, les joueurs d’Origin déterminent le parcours de l’expansion de l’humanité sur notre planète. Les tribus se diversifient peu à peu tout en conservant des liens avec leurs ancêtres et avec tous les habitants de la Terre.
Les pions existent en trois couleurs, trois hauteurs et trois épaisseurs. Au début, l’un des plus petits est placé au centre de l’Afrique. Trois tuiles Technologie sont posées au hasard sur les sections beige, orange et violette du tableau, et six sur la section brune. Les tuiles affichent de une à cinq flèches. Les cartes beige, orange et violettes sont mélangées. Les beiges ont un effet immédiat, les oranges un pouvoir permanent, les violettes un objectif ; si celui-ci est rempli, on le joue et on pioche aussitôt une nouvelle carte. Une seule carte de chaque couleur peut être jouée par tour.
À son tour, un joueur choisit une action. Il peut placer un pion partageant deux caractéristiques avec un voisin, sans être plus petit. Il peut déplacer un de ses pions vers une région vide selon sa hauteur. Il peut aussi prendre une région adverse si son pion est plus épais.
Selon la couleur de la région occupée, il obtient cartes ou tuiles. Les technologies doivent être acquises dans l’ordre croissant, mais plusieurs piles sont possibles. Un seuil technologique est requis pour activer les cartes orange.
Des points sont gagnés en occupant des prairies ou des détroits. La partie se termine lorsque toutes les pièces, tuiles ou cartes d’une couleur sont épuisées, puis on compte les points pour déterminer le vainqueur.