Dans Clans, chaque joueur cherche à marquer le plus de points possible pour sa couleur. La difficulté réside dans le fait que la couleur de chacun est attribuée au hasard et reste secrète jusqu’à la fin.
Le plateau comporte douze régions, chacune divisée en cinq zones de quatre types de terrain différents. Chaque zone reçoit une hutte de chacune des cinq couleurs. À son tour, un joueur déplace toutes les huttes d’une zone contenant moins de sept huttes vers une zone adjacente occupée, tout en dissimulant la couleur qu’il soutient.
Après un déplacement, si une ou plusieurs zones sont entièrement entourées de zones vides, elles sont décomptées. Si toutes les couleurs sont présentes, celles représentées par une seule hutte sont éliminées. La piste d’époque limite le nombre de décomptes et modifie les bonus ou pénalités selon le terrain et l’avancement de la partie.
Lorsque au moins douze zones ont été décomptées, la partie s’achève. Les joueurs révèlent alors leur couleur et celui qui a accumulé le plus de points l’emporte.