Dans Carcassonne: Amazone, les joueurs naviguent sur l’Amazone pour découvrir une faune abondante. Ils marquent des points en révélant des animaux, mais aussi en visitant des villages indigènes et des cours d’eau, tandis que leur bateau progresse le long du fleuve. L’Amazonie regorge de caïmans et de piranhas qui rapportent souvent des points aux joueurs les plus avancés sur la rivière. Les bateaux avancent lorsque des symboles correspondants apparaissent sur les tuiles d’eau ou lorsqu’aucun meeple n’est placé sur un cours d’eau, un village ou une hutte dans la jungle.
Comme dans les autres jeux de la gamme, la partie s’achève lorsque toutes les tuiles ont été posées. Les deux bateaux les plus en aval obtiennent alors des points bonus selon le nombre de joueurs.
Carcassonne: Amazone est le troisième titre de la série Carcassonne autour du monde, après Carcassonne : Mers du Sud et Carcassonne : Ruée vers l’or.