Ensemble, les jeunes détectives traquent Mister X à travers les rues de Londres. Parviendront-ils à deviner où il se réfugiera ensuite, ou Mister X réussira-t-il une nouvelle fois à leur échapper ? Comme son nom l'indique, Scotland Yard Junior n'est pas seulement une version simplifiée de Scotland Yard. Il propose également des règles, une jouabilité et un rythme de jeu sensiblement différents.