Comme dans le jeu vidéo original Minecraft, dans Minecraft : Builders & Biomes, les joueurs explorent le monde, construisent des structures et extraient des ressources. Ils gagnent des points grâce à leurs constructions et aux plus grandes zones connectées de biomes sur leur plateau personnel. Des ennemis emblématiques apparaissent également et doivent être vaincus à l’aide d’armes récupérées, rapportant des points et des bonus. Le score est déclenché lorsque les couches du cube de ressources sont épuisées. Dès que la troisième couche disparaît, la partie se termine et le joueur avec le plus de points gagne. Le décompte a lieu trois fois. D’abord, on choisit un biome et on marque selon la plus grande zone connectée. Ensuite, on choisit un matériau et on marque selon le plus grand groupe de structures correspondant. Enfin, on marque selon le plus grand ensemble de structures d’un type donné, puis on ajoute les points bonus des ennemis vaincus.