Dans Atlantica, les joueurs incarnent des équipes de recherche qui tentent de révéler les secrets de la légendaire cité engloutie décrite par Platon. Pour cela, ils doivent d’abord recruter des plongeurs dans la taverne afin de partir en exploration sous-marine et réserver des navires dans les installations du port pour d’éventuelles chasses au trésor au fond de la mer.
Les trésors d’Atlantis placés en sécurité sur les navires rapportent des points aux chercheurs à la fin de la partie. Lorsqu’un ouragan apparaît à l’horizon, signalé par une carte ouragan proche du bas de la pioche, les joueurs mettent fin à leurs plongées et comptent leurs points.