En 532, le bouddhisme arrive au Japon et s’établit aux côtés du shintoïsme, religion officielle. Le prince Shōtoku, séduit par cette nouvelle foi, charge des moines bouddhistes de bâtir un village doté d’un vaste jardin où seront érigées huit pagodes, les tajuto. Il annonce que lorsque la quatrième tajuto sera achevée, la ville deviendra un haut lieu de pèlerinage. À cet instant précis, le moine ayant atteint le plus haut niveau de spiritualité grâce à la méditation et à ses qualités mentales sera nommé Grand Gardien du Jardin sacré des Huit Pagodes et supervisera le pèlerinage.
Dans Tajuto, les joueurs incarnent des moines cherchant à accroître leur spiritualité. À leur tour, ils activent des tuiles d’action pour piocher et construire des étages de pagode, faire des offrandes afin d’obtenir des points de méditation et acquérir des tuiles apportant des avantages ou des points. Activer plusieurs tuiles ou en acquérir coûte des points de méditation. La partie s’achève lorsque la quatrième pagode est terminée. Le joueur ayant le plus de points de spiritualité l’emporte.
L’élément central du jeu réside dans la pioche des tuiles Pagode depuis un sac. Les étages diminuent en taille à chaque niveau. Les joueurs peuvent tenter de reconnaître la taille au toucher, mais la couleur reste incertaine, les obligeant à évaluer leurs chances.