Les joueurs incarnent les personnages de Dr. Stone et coopèrent pour accomplir l'objectif propre à chaque épisode. De nombreux mystères et rebondissements jalonnent la partie. En combinant des matériaux et en fabriquant de l'équipement, vous découvrirez les moyens d'atteindre vos objectifs. Ce jeu coopératif narratif s'adresse aussi bien aux fans de l'anime ou du manga qu'aux personnes qui ne connaissent pas l'œuvre. Dans chaque épisode, votre mission consiste à fabriquer un « objet objectif » avant la fin du temps imparti. Dans un monde où la science a disparu, les objets du quotidien ont perdu leur utilité. Mais grâce aux connaissances de Senku et à la coopération de ses compagnons, rien n'est impossible.