Dans Tokyo Train, des équipes de deux joueurs s’affrontent pour placer correctement les passagers dans un train selon la configuration indiquée sur une carte.
Au sein de chaque équipe, un joueur tente de guider son partenaire à l’aide de gestes et en prononçant le nom des passagers. Son coéquipier doit alors déplacer les figurines ou pions sur le plateau afin de reproduire la disposition demandée.
La première équipe qui parvient à installer tous les passagers à la bonne place crie « Tokyo Train ! » et remporte la carte. La première équipe à obtenir 7 cartes gagne la partie.