L’Empire de la Lune fait face à de nombreuses menaces. La Faille s’est rouverte, permettant aux créatures tapies dans l’Ombre depuis des millénaires de revenir. Mais le danger vient aussi de l’intérieur : l’Empereur, fils de la Lune, vieillit, et ses anciens seigneurs loyaux cherchent désormais à s’emparer du pouvoir. Pour y parvenir, ils sollicitent les guerriers appelés ninjas, maîtres de la voie du Shinobi. Les clans sont enfin prêts pour la guerre. En tant que seigneur avide de pouvoir, dans Shinobi WAT-AAH! vous ambitionnez de poser votre auguste postérieur sur le trône impérial. Pour cela, vous faites appel aux grands clans de ninjas afin d’imposer votre force militaire à vos ennemis. En résumé, votre objectif est d’infliger un retentissant WAT-AAH! à vos adversaires. Shinobi WAT-AAH! propose deux modes de jeu. Le mode Sauterelle permet de s’initier rapidement à l’art du Shinobi à travers des parties courtes. Le mode Grand Maître vous entraîne sur trois manches, culminant dans une confrontation finale surprenante.