Les Titans, demi-dieux des enfers, menacent l’humanité en semant chaos et désordre. Mais les humains sont prêts à se défendre en créant leurs propres Titans pour contrer ces attaques. Pendant ce temps, les joueurs poursuivent aussi leurs activités quotidiennes : acquérir des marchandises, les transformer en produits de meilleure qualité et les livrer à des navires ou des marchands. Ils peuvent également renforcer leurs Titans et utiliser des troupes pour accroître leur puissance. Pour maintenir leurs partisans actifs, ils doivent disposer de suffisamment de disques d’action.
Panthalos se joue en huit manches maximum, mais la partie peut se terminer plus tôt si les forces des enfers deviennent trop puissantes.