Lorsque les premiers vaisseaux d’exploration ont pénétré l’atmosphère nuageuse de la planète Magnastorm, ils ont découvert non seulement d’abondantes ressources naturelles, mais aussi les vestiges d’une civilisation disparue. Sur ordre de la magistrature, des véhicules d’éclaireurs sont envoyés à la surface aride pour repérer des zones d’exploitation minière.
Dans Magnastorm, l’objectif est d’être le premier à atteindre un certain nombre de points de réputation. On en gagne surtout en accomplissant des objectifs, en prenant le contrôle d’un ou plusieurs des huit commandants et en construisant des stations de transmission. Le jeu repose sur un plateau d’actions composé de deux panneaux de cinq colonnes chacun. À chaque manche, 3 à 5 jetons d’action se trouvent dans chaque colonne du panneau supérieur. Un joueur peut soit déplacer un jeton vers le panneau inférieur pour obtenir des ressources ou payer un déplacement, soit payer le coût des jetons restants d’une colonne afin de contrôler un commandant et utiliser sa capacité.
Une manche se termine lorsque le panneau supérieur est vide, puis les panneaux sont échangés. Ce jeu stratégique met l’accent sur la gestion des ressources, la logistique et le bon timing. En fin de partie, chaque joueur reçoit une carte Récompense parmi 120, utilisable lors de parties ultérieures pour équilibrer les niveaux.